Trzecia część serii Xeno, która służy za sequel Xenosaga Episode I.
Ponownie mamy do czynienia z grą z gatunku jRPG z turowym systemem walki, gdzie do akcji wymagane są punkty akcji, z drobnymi usprawnieniami względem części poprzedniej, jak na przykład trzy poziomy ataków.
Gra kontynuuje wątek z Episode I, z tym że zamiast koncentrować się na Gnosis (zła rasa obcych w grze), skupia uwagę na poszukiwaniach Zohar, wielkiego złotego monolitu, który jest źródłem nieskończonej mocy.
Grafika stoi na równie wysokim poziomie co w części poprzedniej, jednak sama gra została przyjęta z mieszanymi uczuciami, głównie ze względu na uproszczenie fabuły, która nie była już tak głęboka i kontrowersyjna jak w poprzednich częściach, oraz znacznie krótszych przerywnikach filmowych.